Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms