Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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