Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms