Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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NDUFA9Q16795 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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