Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA3Q16787 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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