Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B3Q16720 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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