Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGCAQ16586 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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