Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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