Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKN1Q16512 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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