Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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