Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
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NCOA1Q15788 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
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NCOA1Q15788 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
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NCOA1Q15788 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NCOA1Q15788 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
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NCOA1Q15788 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
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NCOA1Q15788 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
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NCOA1Q15788 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
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