Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX1Q15699 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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