Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP4Q15650 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP4Q15650 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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