Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCEA2Q15560 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCEA2Q15560 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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