Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKIV2LQ15477 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms