Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYTH1Q15438 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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