Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF3B3Q15393 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B3Q15393 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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