Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3CQ15386 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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