Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EXOSC2Q13868 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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