Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms