Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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