Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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