Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1SQ13698 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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