Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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