Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CUL4BQ13620 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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