Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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