Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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