Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF6Q13247 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms