Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2BQ13224 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2BQ13224 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
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