Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF1Q13077 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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