Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRN3Q13033 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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