Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRJQ12913 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRJQ12913 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms