Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 TOP1YOL006C 2310 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 ECM16YMR128W 3804 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 MSH4YFL003C 2637 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 SKP2YNL311C 2292 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 PEX6YNL329C 3093 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 NOT5YPR072W 1683 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 PRM15YMR278W 1869 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 CDC45YLR103C 1953 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 HTA1YDR225W 399 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 CAJ1YER048C 1176 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 HMF1YER057C 390 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YER079C-AYER079C-A 339 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 PET191YJR034W 327 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YOL114CYOL114C 609 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 NUP159YIL115C 4383 nt3.2□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 ISM1YPL040C 3009 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YAK1YJL141C 2424 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 PGA1YNL158W 597 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YNL179CYNL179C 438 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 HSP10YOR020C 321 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 TIM12YBR091C 330 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 RSC1YGR056W 2787 nt3.19□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YLR001CYLR001C 2589 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 RPO31YOR116C 4383 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 BAR1YIL015W 1764 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YCK3YER123W 1575 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 ATP17YDR377W 306 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 ATP8Q0080 147 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 TMA19YKL056C 504 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 DGK1YOR311C 873 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YPS6YIR039C 1614 nt3.18□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YIR040CYIR040C 333 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 RPS7BYNL096C 573 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 RFC3YNL290W 1023 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 TFC1YBR123C 1950 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 SLA1YBL007C 3735 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 LCB4YOR171C 1875 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 NDD1YOR372C 1665 nt3.17□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 APE2YKL157W 2859 nt3.17□□□□□ -1.9 RIP-Chip
MSL5Q12186 YKL222CYKL222C 2118 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 IRC10YOL015W 1761 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 CDC36YDL165W 576 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 ISD11YER048W-A 285 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YFL063WYFL063W 456 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 CDC26YFR036W 375 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 PFD1YJL179W 330 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 IRC23YOR044W 474 nt3.16□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 EMP70YLR083C 2004 nt3.15□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YBP1YBR216C 2025 nt3.15□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YDL180WYDL180W 1644 nt3.15□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 NCR1YPL006W 3513 nt3.15□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 YSW1YBR148W 1830 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YDL242WYDL242W 354 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 ERG28YER044C 447 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 RPL30YGL030W 318 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YGR151CYGR151C 336 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 HYR1YIR037W 492 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 RPS21BYJL136C 264 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 APC9YLR102C 798 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 LSM2YBL026W 288 nt3.15□□□□□ -1.91 RIP-Chip
MSL5Q12186 HCH1YNL281W 462 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 PEX11YOL147C 711 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 ARO1YDR127W 4767 nt3.15□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 NOP19YGR251W 591 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YJL182CYJL182C 318 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 PFY1YOR122C 381 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YPL229WYPL229W 621 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 LTP1YPR073C 486 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 SRP72YPL210C 1923 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YKL100CYKL100C 1764 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 SRP68YPL243W 1800 nt3.14□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 SNX41YDR425W 1878 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 KIN82YCR091W 2163 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 ZDS1YMR273C 2748 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 ENA2YDR039C 3276 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 ENA1YDR040C 3276 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YPL080CYPL080C 327 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 CCM1YGR150C 2595 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 FAT1YBR041W 2010 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 SPC72YAL047C 1869 nt3.13□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YLR352WYLR352W 2424 nt3.12□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 PEX5YDR244W 1839 nt3.12□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 YDR061WYDR061W 1620 nt3.12□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 RAD2YGR258C 3096 nt3.12□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 ALA1YOR335C 2877 nt3.12□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 SRB4YER022W 2064 nt3.12□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 GIS4YML006C 2325 nt3.12□□□□□ -1.91
MSL5Q12186 REC104YHR157W 549 nt3.12□□□□□ -1.91
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