Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMPCAQ10713 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMPCAQ10713 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PMPCAQ10713 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms