Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms