Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4CQ08493 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4CQ08493 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms