Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR1Q08345 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms