Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLEQ07864 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms