Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNDQ07001 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms