Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX4Q06945 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms