Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN11Q06124 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms