Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YKL069WYKL069W 543 nt2.29□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 YLR050CYLR050C 486 nt2.29□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 ESF2YNR054C 951 nt2.29□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 COG3YER157W 2406 nt2.29□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 BRE5YNR051C 1548 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 TIM9YEL020W-A 264 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 BTN2YGR142W 1233 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 RPC25YKL144C 639 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 SME1YOR159C 285 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 YBR197CYBR197C 654 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 YBR287WYBR287W 1284 nt2.28□□□□□ -2.04
CSI1Q04368 IRA2YOL081W 9240 nt2.27□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 MPO1YGL010W 525 nt2.27□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 UTP30YKR060W 825 nt2.27□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YMR320WYMR320W 306 nt2.27□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 ATP20YPR020W 348 nt2.27□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 MUD1YBR119W 897 nt2.27□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 NGG1YDR176W 2109 nt2.27□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 BNI1YNL271C 5862 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 CBF2YGR140W 2871 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YDL118WYDL118W 381 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 SDC1YDR469W 528 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 EST3YIL009C-A 546 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 CAP1YKL007W 807 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YLR217WYLR217W 324 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 GRE2YOL151W 1029 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 SRL4YPL033C 846 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YBR063CYBR063C 1215 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 NUR1YDL089W 1455 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 ALY1YKR021W 2748 nt2.26□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 NSE4YDL105W 1209 nt2.25□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 snR83snR83 306 nt2.25□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 ADK1YDR226W 669 nt2.25□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 UBP16YPL072W 1500 nt2.25□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YEL043WYEL043W 2871 nt2.25□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 RRP12YPL012W 3687 nt2.25□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 VPS38YLR360W 1320 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YDR203WYDR203W 318 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YEA4YEL004W 1029 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YPT52YKR014C 705 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 ATG10YLL042C 504 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YOR392WYOR392W 444 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 CUR1YPR158W 759 nt2.24□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 FKS1YLR342W 5631 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 AFI1YOR129C 2682 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 CKA1YIL035C 1119 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 PAU8YAL068C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 RRT16YNL105W 429 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 BRX1YOL077C 876 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 PAU20YOL161C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 RRP15YPR143W 753 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 CST9YLR394W 1449 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 CSF1YLR087C 8877 nt2.23□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 RAD18YCR066W 1464 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 SIR4YDR227W 4077 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 TOF1YNL273W 3717 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 SLD5YDR489W 885 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 GLC7YER133W 939 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 YJL147CYJL147C 1149 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 TPK3YKL166C 1197 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 ATX1YNL259C 222 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 BFR1YOR198C 1413 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 ESC2YDR363W 1371 nt2.22□□□□□ -2.05
CSI1Q04368 BAS1YKR099W 2436 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 GPI17YDR434W 1605 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 SNA4YDL123W 423 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 ACB1YGR037C 264 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 CSI2YOL007C 1026 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 FYV12YOR183W 390 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 PEX8YGR077C 1770 nt2.21□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 SLK19YOR195W 2466 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YIL166CYIL166C 1629 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 PRP6YBR055C 2700 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 STD1YOR047C 1335 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 KSP1YHR082C 3090 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YDL158CYDL158C 309 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RAV2YDR202C 1056 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YPT6YLR262C 648 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RPS17AYML024W 411 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 POP7YBR167C 423 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 TOR2YKL203C 7425 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 SSP1YHR184W 1716 nt2.2□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YGL024WYGL024W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RPL11BYGR085C 525 nt2.19□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.19□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RPL11AYPR102C 525 nt2.19□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RXT2YBR095C 1293 nt2.19□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 SRP1YNL189W 1629 nt2.19□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 TUS1YLR425W 3924 nt2.18□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YDR262WYDR262W 819 nt2.18□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.18□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 YGR115CYGR115C 780 nt2.18□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 ECI1YLR284C 843 nt2.18□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 URA5YML106W 681 nt2.18□□□□□ -2.06
CSI1Q04368 RGA1YOR127W 3024 nt2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 97 ms