Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YER189W	YER189W	369 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YHL006W-A	YHL006W-A	354 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YIR020C-B	YIR020C-B	735 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YLR271W	YLR271W	825 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	ESF2	YNR054C	951 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YOL134C	YOL134C	390 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	CRS5	YOR031W	210 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YPR153W	YPR153W	423 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	NPR1	YNL183C	2373 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	UBP16	YPL072W	1500 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	INO80	YGL150C	4470 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	snR5	snR5	204 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YDR461C-A	YDR461C-A	243 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YDR537C	YDR537C	606 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	RPS24A	YER074W	408 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	CKA1	YIL035C	1119 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YLR255C	YLR255C	354 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	CSI1	YMR025W	888 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	ISU1	YPL135W	498 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	SDC25	YLL016W	3147 nt		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.78	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	CTF13	YMR094W	1437 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	SAP190	YKR028W	3102 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YCR064C	YCR064C	411 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YGR242W	YGR242W	309 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	Q0017	Q0017	162 nt		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	SCD5	YOR329C	2619 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	FAR7	YFR008W	666 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	SRP21	YKL122C	504 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	RGM1	YMR182C	636 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YPR170C	YPR170C	336 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	TPS2	YDR074W	2691 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	TDA2	YER071C	381 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YAL026C-A	YAL026C-A	438 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	PEP12	YOR036W	867 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YOR169C	YOR169C	465 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	CSM4	YPL200W	471 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YIL166C	YIL166C	1629 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	KAP123	YER110C	3342 nt		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	snR9	snR9	187 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	RPS17B	YDR447C	411 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	RTS3	YGR161C	792 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	RNP1	YLL046C	750 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	RGA2	YDR379W	3030 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	BAS1	YKR099W	2436 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	NEL1	YHR035W	1893 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YDL163W	YDL163W	303 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	TMA20	YER007C-A	546 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	VMA21	YGR105W	234 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	FYV4	YHR059W	393 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	RPS1A	YLR441C	768 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YMR254C	YMR254C	309 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YNL235C	YNL235C	432 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	SHE4	YOR035C	2370 nt		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	GPI17	YDR434W	1605 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	snR59	snR59	78 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	YDR018C	YDR018C	1191 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	OCA6	YDR067C	675 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	GLC7	YER133W	939 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	BRP1	YGL007W	378 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	SYS1	YJL004C	612 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	AIM32	YML050W	936 nt		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	Q04048	AMS1	YGL156W	3252 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	OTU2	YHL013C	924 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	SDL1	YIL167W	633 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YJL202C	YJL202C	348 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	ACF4	YJR083C	930 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	RPS22B	YLR367W	393 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	RPS29A	YLR388W	171 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	GMC2	YLR445W	567 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	RPL36A	YMR194W	303 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	MUD1	YBR119W	897 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YIL080W	YIL080W	4722 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	FAR11	YNL127W	2862 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YDR115W	YDR115W	318 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	EMC4	YGL231C	573 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YLR224W	YLR224W	1110 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	YNL150W	YNL150W	408 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	ALG14	YBR070C	714 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	GDI1	YER136W	1356 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	PSK2	YOL045W	3306 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	HRD3	YLR207W	2502 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	TIF35	YDR429C	825 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	SLX9	YGR081C	633 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SYF1	Q04048	LRP1	YHR081W	555 nt		2.69	□□□□□ -1.98

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