Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 DPB11YJL090C 2295 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 FLO9YAL063C 3969 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 NSP1YJL041W 2472 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 TFB1YDR311W 1929 nt3.8□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 ATG21YPL100W 1491 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 NIC96YFR002W 2520 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YDL242WYDL242W 354 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 RPL27BYDR471W 411 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 PAU10YDR542W 363 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 PAU11YGL261C 363 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 ANB1YJR047C 474 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 PAU4YLR461W 363 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 SHH3YMR118C 591 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 PRP22YER013W 3438 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YTA7YGR270W 4140 nt3.79□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 MSR1YHR091C 1932 nt3.78□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 YGR025WYGR025W 303 nt3.78□□□□□ -1.8
GDE1Q02979 SNT1YCR033W 3681 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 BIT61YJL058C 1632 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 TRZ1YKR079C 2517 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YIR040CYIR040C 333 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YJR023CYJR023C 402 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 UBC7YMR022W 498 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 RPS7AYOR096W 573 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 MDV1YJL112W 2145 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 CCT7YJL111W 1653 nt3.77□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 SNF12YNR023W 1701 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 SMC2YFR031C 3513 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 TSA2YDR453C 591 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 IRC4YDR540C 540 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 CGI121YML036W 546 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 RPL19BYBL027W 570 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 ICY1YMR195W 384 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 FMP23YBR047W 528 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YKL100CYKL100C 1764 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 MKT1YNL085W 2493 nt3.76□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YER181CYER181C 324 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 COX23YHR116W 456 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 JIP3YLR331C 378 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 URA10YMR271C 684 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YPR039WYPR039W 336 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 snR191snR191 274 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 SWD3YBR175W 948 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 AYT1YLL063C 1425 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 SEN54YPL083C 1404 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YAK1YJL141C 2424 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 DIE2YGR227W 1578 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 MED1YPR070W 1701 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.75□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 NOP4YPL043W 2058 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 NOP19YGR251W 591 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 IOC3YFR013W 2364 nt3.74□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 BCH1YMR237W 2175 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 NDT80YHR124W 1884 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 STU2YLR045C 2667 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 RPA135YPR010C 3612 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 CDC50YCR094W 1176 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 APC11YDL008W 498 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YDL068WYDL068W 330 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 PEP8YJL053W 1140 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 RPS21BYJL136C 264 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 RPS7BYNL096C 573 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YOR146WYOR146W 306 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YPL276WYPL276W 438 nt3.73□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 EPL1YFL024C 2499 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 UNG1YML021C 1080 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 GOT1YMR292W 417 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 NSL1YPL233W 651 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 FLO5YHR211W 3228 nt3.72□□□□□ -1.81
GDE1Q02979 NUP159YIL115C 4383 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 PDC2YDR081C 2778 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 AUS1YOR011W 4185 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 FAP7YDL166C 594 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.71□□□□□ -1.82
GDE1Q02979 YKL111CYKL111C 336 nt3.71□□□□□ -1.82
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