Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TOP2BQ02880 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2BQ02880 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms