Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP4Q02446 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP4Q02446 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP4Q02446 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP4Q02446 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP4Q02446 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP4Q02446 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP4Q02446 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms