Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN7AQ01118 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms