Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F1Q01094 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms