Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A1P68400 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms