Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPEP62304 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms